粪菌移植是一种将健康人粪便中的功能菌群移植到患者肠道中，以重新建立肠道菌群平衡，治疗肠道及肠道外疾病的方法。在粪菌移植过程中，移植的细菌不会被消化。

　　这是因为粪菌移植不是直接将粪便灌入患者的肠道中，而是将健康人的发酵粪便的上清液或新鲜粪汁经过处理系统，在高度安全级别的实验室中取得纯化菌群，再将这些菌群输入到患者的肠道中。这些菌群在进入肠道后，可以在肠道中定植并生长繁殖，从而调节肠道菌群平衡，改善肠道功能，并对一些疾病起到治疗作用。

　　因此，粪菌移植中的细菌不会被消化，而是直接在肠道中发挥作用。这种治疗方法已经在一些肠道及肠道外疾病的治疗中取得了良好的效果，为一些难治性疾病提供了新的治疗思路。

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